Die erste Gedenkstätte für die in Paneriai ermordeten Polen – ein Holzkreuz und ein symbolischer Grabstein – wurde im Herbst 1990 auf Initiative eines ehemaligen Mitglieds der polnischen Untergrundbewegung, Helena Pasierbska aus Vilnius, in Paneriai errichtet. Er wurde von dem litauischen Architekten Jaunutis Makariūnas entworfen. Im November 2000 wurde an der Stelle des Denkmals eine vom polnischen Architekten Jarosław Skrzypczyk entworfene Gedenkstätte eingeweiht, die vom Polnischen Rat zum Gedenken an Kampf und Leid finanziert wurde.
Die Errichtung eines Kreuzes in Paneriai im Jahr 1990 zum Gedenken an die dort ermordeten Polen war eine symbolische Erfüllung des Wunsches des Priesters Romualdas Swirkowski, der in Paneriai erschossen wurde. „Ich möchte, dass an dem Ort, an dem ich in Zukunft sterben werde, ein Kreuz errichtet wird...“ – diese Worte schrieb der Priester auf einen Zettel, als er auf einem Lastwagen nach Paneriai transportiert wurde, und warf diesen Zettel aus dem Fenster. Laut Pasierbska war es ein Traum der Polen in der Region Vilnius, in Paneriai auch nur eine bescheidene Gedenkstätte zu errichten.
Auf dem Denkmal sind folgende Worte in litauischer und polnischer Sprache eingraviert: „ZUM GEDENKEN AN DIE VIELEN TAUSENDEN POLEN, DIE IN PANERIAI ERMORDET WURDEN. LANDSLEUTE DER REGION VILNIUS. HERR, GIB DEN TOTEN DIE EWIGE RUHE. UND DAS EWIGE LICHT LEUCHTE IHNEN.“ Hinter dem Denkmal, auf demselben Sockel, steht ein 7 Meter hohes Metallkreuz. Das Denkmal ist von einer Mauer aus Steinblöcken umgeben. An der Innenseite der Mauer befinden sich Tafeln mit den Namen der in Paneriai ermordeten Mitglieder des polnischen Untergrunds. Die Inschrift auf den Tafeln hinter dem Denkmal lautet auf Litauisch und Polnisch: „SOLDATEN DER ARMIA KRAJOWA, DES POLNISCHEN UNTERGRUNDS, VERTRETER DER POLNISCHEN INTELLIGENZ UND JUNGE MENSCHEN, DIE IHR LEBEN FÜR DIE FREIHEIT IHRES HEIMATLANDES GEOPFERT HABEN. EHRE IHREM ANDENKEN. DIE REGIERUNG DER REPUBLIK POLEN.“
Laut der polnischen Historikerin Dr. Monika Tomkiewicz wurden in den Jahren 1941-1944 in Paneriai 1500-2000 Polen ermordet. Prof. Piotr Niwinski und Helena Pasierbska geben höhere Zahlen an, die zwischen 2000 und 20 000 liegen.