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Das Denkmal zur Erinnerung an die in Paneriai ermordeten Juden wurde am 20. Juni 1991, dem 50. Jahrestag des Ausbruchs des Krieges zwischen Nazi-Deutschland und der Sowjetunion und des Holocausts, enthüllt. Das vom Architekten Jaunutis Makariūnas entworfene Denkmal zum Gedenken an die Juden ähnelt den Formen des alten Denkmals, das 1952 von den Sowjets im Zuge der stalinistischen antisemitischen Kampagne gesprengt wurde.
In die Fassade des Granitdenkmals ist eine Inschrift auf Hebräisch und Jiddisch eingemeißelt. Auf der anderen Seite des Denkmals befindet sich eine Inschrift in litauischer, englischer und russischer Sprache: „EWIGES ANDENKEN AN DIE 70 000 JUDEN AUS VILNIUS UND UMGEBUNG, DIE VON DEN NATIONALSOZIALISTISCHEN HENKERN UND IHREN KOMPLIZEN IN PANERIAI ERMORDET UND VERBRANNT WURDEN“.
Die Errichtung des Denkmals wurde von Joshua Epstein, einem ehemaligen Einwohner von Vilnius, der in Israel lebte und seine persönlichen Mittel dafür spendete, und der Jüdischen Gemeinde Litauens initiiert. Die Regierung der Republik Litauen steuerte einen Teil der Mittel bei. Am Vorabend der Enthüllung des Denkmals schrieb Epstein: „Endlich ist in Paneriai <...> ein Denkmal errichtet worden, das der ehemaligen jüdischen Stadt gewidmet ist, die in der ganzen Welt als das Jerusalem Litauens bezeichnet wurde. Wir haben endlich unsere heilige Pflicht gegenüber unseren Eltern, Brüdern und Schwestern erfüllt <...>“. An diesem Denkmal wird der Gedenktag an die Opfer des Völkermordes an den Juden Litauens am 23. September begangen.
